Un espai natural protegit requereix de l’existència de tota una sèrie de recursos naturals amb interés per a la seua conservació. La biodiversitat que ofereix el parc al seu entorn és una de les referències amb més importància per a la seua protecció i conservació. Amb l’objectiu d’avaluar el grau el espais naturals protegits, el Servei de Vida Silvestre i el Banc de Dades de la Biodiversitat de la Generalitat Valenciana fa un seguiment i analitzen cada dos anys la riquesa d’espècies que alberguen els Parcs Naturals de cada comunitat.

Els estudis que han realitzat aquest any als parcs naturals han mostrat que la Font Roja és l’espai natural protegit amb més biodiversitat de la Comunitat Valenciana. Han comptabilitzat un total de 2.406 espècies diferents. Destaca especialment la identificació de 9 espècies de papallones nocturnes que no havien sigut registrades prèviament a la Font Roja. També s’ha trobat per primera volta la nidificació del corb, amb la identificació d'una parella amb cries. Amb aquest tipus descobriments es pot comprovar com la biodiversitat d’un Parc Natural està sempre en constant evolució.

A més d’aquest estudi, fonts del Parc Natural de la Font Roja han fet públic el desenvolupament que han tingut les caixes-niu instal·lades a l’area del Santuari. Aquestes caixes estan dissenyades per facilitar el niu a les aus de l’entorn i han tingut un èxit del 66%. La majoria han sigut ocupades per parelles de ferreret, ‘Cyanistes caeruleus’. El seguiment d’aquestes caixes niu s’ha pres com a per poder avaluar l’afecció del canvi climàtic a les comunitats d’aus del Carrascal. De moment el parc ha constatat una tendència a la baixa de certes espècies lligades íntimament als boscos com ara el pinsà comu ‘Fringilla coelebs’. De confirmar-se aquesta tendència les poblacions d’aus de la Font Roja podria canviar a llarg termini.